Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkcshO08795 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkcshO08795 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkcshO08795 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms