Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tcof1O08784 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tcof1O08784 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcof1O08784 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcof1O08784 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcof1O08784 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tcof1O08784 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcof1O08784 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcof1O08784 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tcof1O08784 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms