Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nfil3O08750 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nfil3O08750 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms