Protein–RNA interactions for Protein: O08739

Ampd3, AMP deaminase 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd3O08739 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ampd3O08739 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ampd3O08739 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ampd3O08739 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ampd3O08739 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms