Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MttpO08601 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MttpO08601 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MttpO08601 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MttpO08601 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MttpO08601 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MttpO08601 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MttpO08601 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MttpO08601 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MttpO08601 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MttpO08601 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MttpO08601 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MttpO08601 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MttpO08601 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MttpO08601 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MttpO08601 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MttpO08601 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MttpO08601 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MttpO08601 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MttpO08601 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MttpO08601 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MttpO08601 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MttpO08601 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MttpO08601 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MttpO08601 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MttpO08601 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MttpO08601 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MttpO08601 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MttpO08601 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MttpO08601 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MttpO08601 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MttpO08601 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MttpO08601 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MttpO08601 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MttpO08601 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MttpO08601 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MttpO08601 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MttpO08601 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MttpO08601 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MttpO08601 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MttpO08601 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MttpO08601 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MttpO08601 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MttpO08601 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MttpO08601 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MttpO08601 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MttpO08601 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MttpO08601 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MttpO08601 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MttpO08601 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MttpO08601 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MttpO08601 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MttpO08601 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MttpO08601 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MttpO08601 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MttpO08601 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MttpO08601 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MttpO08601 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MttpO08601 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MttpO08601 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MttpO08601 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MttpO08601 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MttpO08601 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MttpO08601 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MttpO08601 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MttpO08601 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MttpO08601 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
MttpO08601 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MttpO08601 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MttpO08601 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MttpO08601 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MttpO08601 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MttpO08601 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MttpO08601 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MttpO08601 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MttpO08601 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MttpO08601 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MttpO08601 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MttpO08601 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MttpO08601 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MttpO08601 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MttpO08601 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
MttpO08601 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MttpO08601 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MttpO08601 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MttpO08601 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
MttpO08601 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
MttpO08601 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms