Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm5294J3QP53 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm5294J3QP53 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm5294J3QP53 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm5294J3QP53 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5294J3QP53 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5294J3QP53 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms