Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp616J3QN14 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp616J3QN14 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp616J3QN14 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp616J3QN14 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp616J3QN14 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp616J3QN14 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp616J3QN14 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp616J3QN14 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp616J3QN14 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp616J3QN14 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp616J3QN14 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp616J3QN14 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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