Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Ms4a18J3QN01 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ms4a18J3QN01 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Ms4a18J3QN01 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ms4a18J3QN01 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Ms4a18J3QN01 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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Ms4a18J3QN01 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Ms4a18J3QN01 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Ms4a18J3QN01 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Ms4a18J3QN01 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Ms4a18J3QN01 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Ms4a18J3QN01 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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Ms4a18J3QN01 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ms4a18J3QN01 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ms4a18J3QN01 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ms4a18J3QN01 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a18J3QN01 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a18J3QN01 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ms4a18J3QN01 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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