Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top6blJ3QMY9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Top6blJ3QMY9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top6blJ3QMY9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Top6blJ3QMY9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms