Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700014D04RikJ3QMS2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700014D04RikJ3QMS2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700014D04RikJ3QMS2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700014D04RikJ3QMS2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700014D04RikJ3QMS2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700014D04RikJ3QMS2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700014D04RikJ3QMS2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700014D04RikJ3QMS2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700014D04RikJ3QMS2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms