Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm21818J3KMS6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm21818J3KMS6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21818J3KMS6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21818J3KMS6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21818J3KMS6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21818J3KMS6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21818J3KMS6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21818J3KMS6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21818J3KMS6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21818J3KMS6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21818J3KMS6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm21818J3KMS6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm21818J3KMS6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms