Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Gm21897J3KMP5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21897J3KMP5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21897J3KMP5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms