Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp2b1G5E829 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp2b1G5E829 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp2b1G5E829 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms