Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r58G3X9U3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vmn1r58G3X9U3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms