Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnf148G3X9R7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Rnf148G3X9R7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms