Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arfgef1G3X9K3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arfgef1G3X9K3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arfgef1G3X9K3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms