Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chrna9G3X8Z7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chrna9G3X8Z7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms