Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm8909G3UXE9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm8909G3UXE9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms