Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Speer4cG3UXD1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Speer4cG3UXD1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms