Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm17455G3UW87 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17455G3UW87 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17455G3UW87 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17455G3UW87 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17455G3UW87 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm17455G3UW87 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17455G3UW87 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Gm17455G3UW87 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gm17455G3UW87 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17455G3UW87 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17455G3UW87 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17455G3UW87 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17455G3UW87 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Gm17455G3UW87 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm17455G3UW87 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm17455G3UW87 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Gm17455G3UW87 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm17455G3UW87 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Gm17455G3UW87 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Gm17455G3UW87 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm17455G3UW87 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms