Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NpcdF8VQB8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NpcdF8VQB8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NpcdF8VQB8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms