Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm5160F8VPN3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm5160F8VPN3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm5160F8VPN3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms