Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdh11xF6ZNL5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdh11xF6ZNL5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdh11xF6ZNL5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 242.4 ms