Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm20538F6Z9R1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Gm20538F6Z9R1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms