Protein–RNA interactions for Protein: F6W3F3

Gm21974, Predicted gene 21974 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21974F6W3F3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm21974F6W3F3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm21974F6W3F3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm21974F6W3F3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms