Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm28305F6U473 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28305F6U473 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28305F6U473 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm28305F6U473 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm28305F6U473 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms