Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss56F2YMG0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss56F2YMG0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss56F2YMG0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss56F2YMG0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss56F2YMG0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss56F2YMG0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss56F2YMG0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Prss56F2YMG0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prss56F2YMG0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prss56F2YMG0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms