Protein–RNA interactions for Protein: E9QAN8

Pik3c2b, Phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase catalytic subunit type 2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2bE9QAN8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Pik3c2bE9QAN8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pik3c2bE9QAN8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Pik3c2bE9QAN8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pik3c2bE9QAN8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms