Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TrdnE9Q9K5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TrdnE9Q9K5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TrdnE9Q9K5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms