Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdhr2E9Q7P9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdhr2E9Q7P9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdhr2E9Q7P9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdhr2E9Q7P9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdhr2E9Q7P9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdhr2E9Q7P9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdhr2E9Q7P9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdhr2E9Q7P9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdhr2E9Q7P9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdhr2E9Q7P9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdhr2E9Q7P9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdhr2E9Q7P9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdhr2E9Q7P9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms