Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Srsf11E9Q6E5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Srsf11E9Q6E5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms