Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn2r48E9Q5D8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn2r48E9Q5D8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms