Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trip11E9Q512 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trip11E9Q512 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trip11E9Q512 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms