Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
8030474K03RikE9Q4Y8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
8030474K03RikE9Q4Y8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
8030474K03RikE9Q4Y8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms