Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17727E9Q4V7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm17727E9Q4V7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm17727E9Q4V7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm17727E9Q4V7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm17727E9Q4V7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm17727E9Q4V7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm17727E9Q4V7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm17727E9Q4V7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm17727E9Q4V7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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