Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc71lE9Q4T4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc71lE9Q4T4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc71lE9Q4T4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms