Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krtap11-1E9Q2E9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Krtap11-1E9Q2E9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms