Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
NebE9Q1W3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
NebE9Q1W3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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