Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzd2E9Q1M1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdzd2E9Q1M1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pdzd2E9Q1M1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pdzd2E9Q1M1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pdzd2E9Q1M1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pdzd2E9Q1M1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pdzd2E9Q1M1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Pdzd2E9Q1M1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd2E9Q1M1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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