Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Zfp558E9Q1J0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Zfp558E9Q1J0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Zfp558E9Q1J0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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