Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt78E9Q0F0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt78E9Q0F0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt78E9Q0F0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms