Protein–RNA interactions for Protein: E9Q069

Vmn1r157, Taste receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r157E9Q069 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r157E9Q069 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r157E9Q069 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r157E9Q069 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r157E9Q069 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r157E9Q069 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms