Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm9972E9Q053 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm9972E9Q053 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm9972E9Q053 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms