Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Fndc1E9Q043 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Fndc1E9Q043 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Fndc1E9Q043 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Fndc1E9Q043 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms