Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ryr1E9PZQ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ryr1E9PZQ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms