Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Scaf11E9PZM7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Scaf11E9PZM7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Scaf11E9PZM7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Scaf11E9PZM7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms