Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rsph10bE9PYQ0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rsph10bE9PYQ0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rsph10bE9PYQ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms