Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim30bE9PVL6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim30bE9PVL6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim30bE9PVL6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms