Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Zscan18E9PUD6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zscan18E9PUD6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Zscan18E9PUD6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms