Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
5430403G16RikD3Z5L4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms